بعضی از والدین باور دارند که رژیم غذایی بدون گلوتن می تواند به کودکان با اختلال اتیسم کمک کند اگرچه این ایده بحث برانگیز است. تئوری های وجود دارد که می گویند کودکان مبتلا به اتیسم به گلوتن حساس هستند و اجتناب از این پروتئین می تواند علائم خاصی را بهبود دهد مثل گفتار یا رفتار اجتماعی. در حال حاضر تحقیقات کافی برای تایید یا رد کارآمدی رژیم غذایی بدون گلوتن در افراد با اتیسم وجود ندارد.