اینکه لیکوپن ( رنگدانه ای در گوجه که باعث رنگ قرمز می شود) دلیل اصلی است یا ماده ای دیگر هنوز مشخص نیست. اما برخی مطالعات خوردن گوجه فرنگی را با کاهش ریسک ابتلا به چندین سرطان از جمله سرطان پروستات، مرتبط دانسته اند. مطالعات همچنین نشان داده اند که محصولات فراوری شده از گوجه فرنگی مانند: آب گوجه فرنگی، سس و یا رب گوجه نیز دارای خواص ضد سرطان می باشند.