پزشکان هنوز به صورت دقیق نمی دانند که چه چیزی باعث ابتلای افراد به اختلال دوقطبی می شود. نظریه های اخیر بیان کرده اند که این اختلال ممکن است حاصل ژنتیک و سایر فاکتورهای بیولوژیکی ( و نیز محیطی) باشد. دانشمندان بر این باورند که مدارهای موجود در مغز که در تنظیم خلق و خو، انرژی ، تفکر و ریتم بیولوژیکی درگیر هستند در افرادی که به اختلال دوقطبی مبتلا می باشند به درستی کار نمی کند. همین امر موجب می شود تغییراتی در خلق و خو و نیز سایر تغییرات مرتبط با بیماری ایجاد شود.