واکسن تنها برای جلوگیری ازعفونت HPV استفاده می شود و نمی تواند آن را درمان کند. واکسن ها در صورتی موثر می باشند که قبل از اینکه فرد از نظر جنسی فعال شود استفاده گردند. CDC توصیه می کند که به پسران و دختران یک سری واکسن HPV را زمانی که آنها 11 یا 12 ساله هستند بدهند.