سه راه برای پاکسازی وجود دارد. بریدن پوست خالکوبی شده، محو کردن پوست ( dermabraison: جراحی برداشت پوست)، یا پاکسازی با لیزر. اکثر پزشکان لیزر را ترجیح میدهند. عکس زیر نمونهای از خالکوبی برداشته شده است. اثر زخم زیر آن به علت پاکسازی با روش جراحی برداشت پوست بوجود آمده است. پاکسازی برخی جوهرهای رنگی سخت تر بوده و به چندین جلسه نیاز است.خالکوبی هرگز صد در صد پاک نمیشود. از محصولات پاکسازی خالکوبی در خانه استفاده نکنید. این محصوات حاوی اسید بوده و میتوانند واکنشای خطرناک پوستی را به همراه داشته باشند. بهترین راهحل مراجعه به پزشک است و نه افرادی که خالکوبی انجام میدهند.